Инициатор за създаването на ЕРБОЖ е акад. Игнат Емануилов. Строителството на сградния фонд на ЕРБОЖ започва през 1969г. и окончателно завършва през 1974г. През 1971г. ЕРБОЖ е официално пусната в експлоатация. От 1 април 2013г. с решение на Общото събрание на БАН базата е присъединена към Институт по невробиология –БАН.
В ЕРБОЖ от години се развъждат лабораторни животни главно: бели мишки – линия ICR, бели плъхове – линия Wistar, зайци – породи: калифорнийски, новозенландски и смесени. От лицензирани развъдници в чужбина са закупени и допълнително се развъждат мишки породи Balb/C, C57 black и плъхове порода Wistar Kyoto и SHR.
